En 1979, empezó sus estudios de hostelería en la escuela de pastelería moderna de Yssingeaux, donde conoció a diversos chefs internacionales. En 1981, se convirtió en responsable De Bodegón Alejandro, que recibió su primera estrella Michelin en 1986.

En 1993 abrió su primer restaurante, llamado "Martín Berasategui", en Lasarte-Oria. En tres años, el local recibió dos estrellas Michelin.

En su extensa trayectoria, con más de veinte años de experiencia, ha recibido prestigios premios, como: mejor repostero español del año, mejor plato creativo y mejor plato del año en 1995, al año siguiente fue condecorado como el Mejor Cocinero Español.

Martín se convirtió en la figura modelo para la nueva generación de jóvenes chefs euskaldunes, lista para suceder a los Arzak y Subijana. 

En 1996, el chef decide crear una asociación empresarial, el Grupo Martín Berasategui, para hacerse cargo de restaurantes tales como: el Bodegón Alejandro; el restaurante del Guggenheim de Bilbao o el Kursaal Martín Berasategui.

A partir de ahí el cocinero recibió un diversos premios, entre ellos el Premio Euskadi de Gastronomía al Mejor Cocinero de Euskadi en 1998 y el Tambor de Oro de San Sebastián en 2005.  

Ese mismo año es elegido, junto a Michel Bras, como uno de los dos mejores chefs europeos por las votaciones realizadas entre 35 chefs tres estrellas Michelin.

El 28 de septiembre de 2009, inaugura el primer restaurante dirigido por un cuatro estrellas Michelin en China, en el Restaurant Martin, de Shanghai.

En noviembre de 2009, la “Guía Michelin” otorga la segunda estrella al restaurante Lasarte del Hotel Condes de Barcelona y la primera al restaurante MB del complejo turístico Abama; un año más tarde, el restaurante Santo by Martín Berasategui de Sevilla es reconocido con su primera estrella.

Todos ellos son asesorados por Berasategui, quien en 2011 se convierte en el único chef con siete estrellas en España.

La clave de su éxito está en el "trabajo, la ilusión y la generosidad"; y esto se traduce en sus recetas, que han hecho una cocina que el propio Martín ha definido en diversas ocasiones como muy técnica, pero nada academicista; respetuosa del producto y las estaciones, pero también viajera y aventurera; sólida y divertida; profundamente vasca, rabiosamente joven.

Su restaurante más conocido se encuentra ubicado en Lasarte, con una calificación de 3 estrellas, en la Guia Michelin. Martin es considerado uno de los mas conocidos y grandes representantes de la nueva cocina vasca.

Caracterizado por una cocina actual, equilibrada y estética, ofrece platos de carta y el Gran Menú degustación (195€ sin bebidas), que consta de aperitivos como el milhojas caramelizado de anguila ahumada, foie gras, cebolleta y manzana verde o el caldo de chipirón salteado con do crujiente y ravioli cremoso relleno de su tinta; platos variados como la ostra con pepino, kafir y coco, el ajo negro salteado con ceviche de remolacha, granizado de rábano y crema raifort, el foie asado con algas reposado sobre cuajada de raifort, caldo de soja fermentado y sal de avellana o el pichón asado y cebolla con careta ibérica, jugo de jengibre y alcaparra, entre otros, además de dos postres: el de manzana, limón, apio, pepino, ginebra y menta, y la niebla de café y cacao sobre plátano con sorbete y granizado de whisky.

La sala está dirigida por Oneka Arregui, esposa del chef, y el restaurante cuenta con una espléndida bodega.